U dieťatka matky liečenej metadónom sa môže vyvinúť abstinenčný syndróm. Vzdelaní novorodeneckí lekári ho však vedia zachytiť a liečiť, aby dieťatko nemuselo trpieť. Napriek tomu, že deti narodené matkám v metadónovej liečbe, sú na tom zdravotne oveľa lepšie ako deti narodené matkám so závislosťou bez liečby, stále je ich pôrodná váha o niečo menšia. Vedecké štúdie však ukazujú, že ich psychomotorický a neskorší mentálny vývin sa nelíšil od detí matiek, ktoré neužívali drogy. Deti nedobehli svojich rovesníkov iba vtedy, ak matky okrem metadónu užívali v tehotenstve ešte ďalšie drogy.