Ministerstvo školstva SR totiž pri rozdeľovaní mzdových prostriedkov jednotlivým VŠ nebralo uvedený zákon do úvahy. Aj na túto skutočnosť poukázali členovia Klubu dekanov vysokých škôl na svojom dvojdňovom zasadaní, ktoré sa skončilo dnes v rekreačnom stredisku v Račkovej doline (okres Liptovský Mikuláš).
Terajší systém mzdového ohodnotenia vysokoškolských učiteľov ich nemotivuje ku kvalitnejšej práci. Dekani fakúlt totiž na ich odmeňovanie jednoducho nemajú financie. Predseda ich klubu Jozef Lobodka priznal, že podľa zákona o verejnej službe sa zvýšili tarifné platy pracovníkom VŠ, ale po zrušení osobných príplatkov zostali na rovnakej úrovni, ba neraz aj poklesli.
Klub dekanov vo svojom vyhlásení označil nový zákon o vysokých školách vo viacerých častiach za nevyhovujúci. Dekani nie sú spokojní najmä so zrušením právnej subjektivity fakúlt. Ministra školstva žiadajú, aby im umožnil vyjadrovať sa ku všetkým pripravovaným alebo novelizovaným všeobecne záväzným právnym predpisom, ktoré môžu upravovať chod fakúlt.
Za nelogické považuje Lobodka, že VŠ musia podľa nového vysokoškolského zákona odvádzať daň z podnikania, ako aj platiť rôzne správne a colné poplatky. Podľa starého zákona to tak nebolo. Vysoké školy takto nepriamo vrátia časť svojich financií pridelených zo štátneho rozpočtu späť štátu.