Dušan Třeštík sa špecializoval na dejiny raného a vrcholného stredoveku v stredovýchodnej Európe v 6. až 12. storočí, dejiny kultúry a teóriu histórie. Vyjadroval sa však i k súčasným politickým a kultúrnym otázkam.

Medzi jeho najvýznamnejšie diela za posledných desať­ rokov patrí monografia Počátky Přemyslovců, Vstup ­Čechů do dějin (530 - 935), Mysliti dějiny a Vznik Velké Moravy. Moravané, Čechové a střední Evropa v letech 781 - 871.

Tento rok Třeštíkovi udelili za popularizáciu vedy Medailu Vojtěcha Náprstka. Zaujímal sa aj o poéziu a počítače, bol aj príležitostným novinárom. Nikdy nebol členom nijakej politickej strany. Sám seba charakterizoval ako „liberálneho pokrokára“.