V roku 1995 prehral súboj o prezidentské kreslo až v druhom kole. O päť rokov neskôr však získal len pár percent. Keď teraz oznámil, že v auguste na 25. výročie prvých rozhovorov komunistického režimu so Solidaritou definitívne odchádza z politiky, takmer nikto sa ho nepokúsil presviedčať o opaku.

Walesa posledné roky prednášal v zahraničí a doma bojoval za očistenie svojho mena. Najviac energie dáva do sporu s radikálnymi pravičiarmi, ktorí ho obviňujú, že bol agentom štátnej bezpečnosti.

Lustračný súd pred voľbami v roku 2000 síce zistil, že Walesa agentom nebol. On však naďalej hľadá potvrdenia tejto pravdy. V Ústave národnej pamäti, ale aj u generála Wojciecha Jaruzelského, posledného poľského komunistického prezidenta. Prednedávnom sa verejne stretli prvýkrát od roku 1989 a pre mnohých bolo trápne počúvať, ako Walesa v televízii prosí Jaruzelského o potvrdenie, že nebol agentom tajnej služby. Ústav národnej pamäti pritom zverejnil, že Jaruzelski bol agentom sovietskej tajnej služby.

Walesa dlhé roky tvrdo bojoval s komunistami. Tento rok sa niečo zlomilo a urobil prvé kroky k zmiereniu. Bývalému komunistickému funkcionárovi a súčasnému prezidentovi Aleksandrovi KwaĘniewskému prvý raz podal ruku na pohrebe pápeža Jána Pavla II. Neskôr ho dokonca pozval na oslavu menín, ktoré každoročne vo veľkom štýle oslavuje 18. júna. Ešte pred desiatimi rokmi pritom hovoril, že Kwašniewskému môže podať len nohu.