Z hľadiska zdravia je podstatné, aby voda určená na kúpanie nebola znečistená nad povolenú mieru predovšetkým z mikrobiologickej stránky. Patogénne alebo podmienečne patogénne mikroorganizmy totiž môžu vyvolať zápaly spojiviek, hnačkové choroby, kožné hnisavé, ale aj plesňové ochorenia. Pokiaľ ide o umelé kúpaliská, tam je veľmi dôležité, ako sa dodržiava podľa stanovených predpisov koncentrácia takzvaného voľného chlóru, ktorý sa dávkuje recirkulačnými zariadeniami. Na jednej strane môže jeho nedostatok spôsobiť premnoženie mikróbov, a na druhej jeho prebytok môže u precitlivených jedincov alebo u detí vyvolať aj podráždenie kože a očných spojiviek.