mu už žiadne lepšie zmluvy neprinesie, prípadnou porážkou by mohol len stratiť, a tak Tour vynechal.
Vrátil sa ako 33-ročný v roku 1966, aby sa pokúsil dosiahnuť šieste víťazstvo. Francúz trpiaci bronchitídou sa však napokon postaral len o to, že jeho dlhoročný rival a hlavný favorit Raymond Poulidor nezvíťazil. Z ich súperenia sa medzičasom stalo otvorené nepriateľstvo, dokonca sa spolu ani nerozprávali. Na Tour sa navzájom strážili, čo dávalo šancu na úniky iným pretekárom. Jedna taká skupina si vyjazdila v Pyrenejách sedemminútový náskok. Ten sa stal základom, na ktorom vybudoval svoj prekvapujúci triumf na Tour Poulidorov mladý tímový kolega Lucien Aimar. Anquetil skončil druhý za Poulidorom v časovke jednotlivcov vo Vals-les-Bains a druhý pred Poulidorom v horskej etape do Brianconu, napokon sa však v etape zo Chamonix do St. Etienne vzdal.
Rok 1966 bol poznačený aj prvými dopingovými testmi, čo viedlo k štrajkom pretekárov. Anquetil zomrel v roku 1987 na rakovinu žalúdka.
