V roku 1968 sa stal profesorom filozofie, o dva roky neskôr ho prepustili, lebo neodvolal svoj protest proti sovietskej okupácii. V sedemdesiatych a osemdesiatych rokoch bol významnou postavou opozičného hnutia, prednášal na takzvaných bytových univerzitách, na ktorých pôsobili vzdelanci, ktorých z vysokých škôl vyhodili. V pražskom Kostole sv. Antonína hrával na organ.
Od roku 1990 znovu učil na Karlovej univerzite a o jeho knihy bol veľký záujem. Napísal vyše desať filozofických kníh, niektoré vyšli v mnohých prekladoch. K najznámejším z nich patrí Ježíš.
Machovec bol učiteľom viacerých generácií. Filozof Václav Bělohradský, básnik Egon Bondy či napríklad Jan Palach boli jeho žiakmi. (čtk)