Systém stanovuje emisné limity veľkým znečisťovateľom, ako sú elektrárne a ropné rafinérie. Podniky, ktoré znečisťujú menej, môžu v rámci tohto systému prebytočné kvóty predať firmám, ktoré kvóty prekračujú. Asociácia európskych leteckých spoločností (AEA) informovala, že jej členovia budú pravdepodobne musieť povolenky dokupovať, pretože limity pre leteckú prepravu budú príliš prísné. „Bude to bremeno a mohlo by to byť ťažké bremeno,“ povedala hovorkyňa AEA Francoise Humbertová. Dodala, že aerolínie nebudú môcť vzhľadom na silne konkurenčné prostredie preniesť všetky dodatočné náklady na cestujúcich.
Komisia predpokladá, že ceny leteniek na menšie vzdialenosti do roku 2020 stúpnu o 1,8 až 9 eur. „Očakáva sa, že akýkoľvek nárast nákladov súvisiacich s týmto systémom bude obmedzený a výrazne nižší ako nárast spôsobený zmenami cien ropy v posledných rokoch,“ zdôraznila komisia.