Tichá a Kôprová dolina
už podľa koncepcií ochrany prírody zo 60. rokov malo ísť o bezzásahové územie, pre ochranárov je veľmi dôležité, má byť jadrom bezzásahovej A-zóny
Bielovodská a Javorová dolina
krásne a málo navštevované doliny na severovýchode TANAP-u, ochranári ich chcú v A-zóne, Štátne lesy TANAP-u zase v B-zóne
Medzi ochranármi a súkromnými vlastníkmi lesov
Liptovské urbáre
ide o hrebene dolín v Západných Tatrách: Račkovej, Jamnickej, Suchej a Žiarskej doliny. Neštátni vlastníci súhlasia s ponechaním v A-zóne na hrebeňoch, kde už nie je možné ťažiť drevo, no nesúhlasia so zaradením spodných častí dolín do A-zóny. Za nehospodárenie v týchto lesoch im má štát vyplácať kompenzácie, získať ich je však administratívne veľmi náročné a ministerstvo životného prostredia s vyplácaním mešká. Bohdan Palka z Liptovského regionálneho združenia vlastníkov lesov pre TASR povedal, že vylúčenie akejkoľvek hospodárskej činnosti z týchto lesov bez finančnej náhrady je prejavom nerešpektovania základných ľudských práv.
Medzi ochranármi a podnikateľmi
Správa TANAP-u vedie spor aj s majiteľmi lyžiarskych stredísk, ktorých podporuje aj Mesto Vysoké Tatry. Mesto vidí v rozvoji lyžovania priestor na rozvoj cestovného ruchu a rozvoj územia. V okolí Skalnatého plesa už v minulosti žiadali majitelia preradenie plochy zjazdovky z najprísnejšieho 5. stupňa ochrany do 2. či 3. stupňa. Ochranári súhlasili len so 4. stupňom, pretože v ňom ešte môžu rozhodovať o organizovaní hromadných podujatí spojených s hlukom a so svetelnými efektmi. V prípade zonácie by podnikatelia prijali zaradenie do D-zóny. Igor Poničan z J&T, ktorá vlastní lanovku na Sklanaté pleso, hovorí, že "určité dohody sa črtajú, no ide to dosť pomaly". (haj)