Kôstkoviny patria medzi obľúbené a výživne hodnotné druhy ovocia. Ich podiel na štruktúre ovocných druhov v záhradkách je zatiaľ nízky a ich pestovanie prekonáva určitú stagnáciu. Ešte v nedávnej minulosti sa vysádzali prevažne v tvare vysokokmeňov a polkmeňov, ktoré zaberali veľa miesta a zber ich plodov bol ťažší.
Slivky domácich odrôd (najmä Bystrická) postupne likviduje šarka. Ekologicky hospodáriaci pestovatelia preto uprednostňujú pri výsadbe nízke tvary kôstkovín a odrody odolné alebo aspoň tolerantné proti závažným chorobám, mrazom a niektorým fyziologickým poruchám.
Pre nízke tvary čerešní a višní (štíhle vreteno a iné slaborastúce vretená) volíme slabšie až slaborastúce podpníky P-HL-A až C alebo Colt, Maxma Delbard 14 a Weiroot. Pre nízke tvary slivkovín a marhúľ možno použiť podpníky S-BO-1, Ferlemain a Saint Julien A, pri marhuliach aj mirobalány MY-KL-A, MY-VS-1 a Pixy.
Na jeseň vysádzame z kôstkovín čerešne, višne a slivkoviny. Broskyne a v menej teplých oblastiach i marhule vysádzame až na jar. Pri jesennej výsadbe uprednostňujú záhradkári uplatňujúci alternatívne metódy predovšetkým úrodné a kvalitné odrody, odolné alebo aspoň tolerantné proti závažným chorobám a škodlivým činiteľom, ako aj proti niektorým fyziologickým poruchám.
Z višní možno medzi ekologické odrody zaradiť hlavne odrody Andrea, Anka, Favorit, Meteor korai, Morella neskorá, Morsam, Samor a Viola.
Zo sliviek a slív uprednostňujeme odrody odolné alebo aspoň tolerantné proti šarke. Medzi odolné patria najmä nemecké odrody Elena, Hanita, Jojo, Katinka a ďalšie, ktoré sú v odrodových skúškach. Z tolerantných možno odporučiť juhoslovanské odrody Čačanska najbolja, Čačanska lepotica, Čačanska raná, nemecké odrody Anna Späth a Presenta, americkú Stanley, anglickú President a tiež Valjevku.
Z čerešní sú to najmä chrupky (s tuhou dužinou) Burlat, Kordia, Regina, Sam, Summit, Těchlovan, Van a Vanda. Zo srdcoviek (s mäkkou dužinou) sú to predovšetkým Gaštanka, Karešova, Rivan, Rýchlica a Winklerova. Medzi ekologické odrody ringlot patria Althanova, Wazonova a Zelená ringlota.
Ekologická je aj odroda mirabelky Nancyská.
Ak sa záhradkári rozhodnú vysádzať na jeseň i marhuľové stromčeky, majú k dispozícii bohatý výber zo slovenských a moravských odrôd, ktoré sú prevažne mrazuvzdorné. Zo slovenských patria medzi skoré Velita, Veselka a Vegana. Zo stredne neskorých možno odporučiť najkvalitnejšiu a najúrodnejšiu odrodu Veharda, odolnú proti šarke sliviek (vhodná do všetkých pestovateľských oblastí). Z neskorých odrôd je ekologická Vemina a na priamu konzumáciu sa najlepšie hodí Vestar, ktorá dobre znáša prepravu.