31. august 1995 - Organizovanou skupinou osôb bol zavlečený do cudziny syn prezidenta SR Michal Kováč ml. Napriek tomu, že vyšetrovatelia zhromaždili dôkazy o účasti SIS na tomto trestnom čine, prípad bol uložený a dodnes nebol uzavretý. Zastupujúci prezident V. Mečiar únos amnestoval.
29. apríl 1996 - Na Karloveskej ulici v Bratislave vybuchlo počas jazdy auto, ktoré šoféroval Róbert Remiáš. Remiáš bol spojkou korunného svedka kauzy zavlečenia M. Kováča ml. do cudziny Oskara Fegyveresa. Remiáša pred zavraždením sledovali príslušníci SIS s osobami z podsvetia.
5. máj 1996 - V záhrade domu poslanca a predsedu MKDH Bélu Bugára vybuchol granát. Páchateľ nebol zistený.
26. august 1996 - Nadránom vybuchla nálož na Kamennom námestí v Bratislave umiestnená pri zmenárni Mariána Lenčeša. Pri výbuchu zahynul 26-ročný príslušník polície, ktorý na mieste činu nebol služobne. Motívy explózie ani prítomnosti policajta neboli objasnené.
6. december 1996 - Pred vchodom domu poslanca Františka Gauliedera vybuchla nálož. Gaulieder bol tesne predtým vylúčený vládnou koalíciou z parlamentu, pretože vystúpil z poslaneckého klubu HZDS. Pred výbuchom ho sledovali autá odboru sledovania SIS. Prípad bol uložený.
6. február 1997 - Pred hotelom Holiday Inn v Bratislave bol rituálne popravený boss podsvetia Miroslav Sýkora. Páchatelia neboli zistení.
10. február 1997 - Na Jungmannovej ulici v Bratislave bol zastrelený bývalý ústredný tajomník SNS Jozef Matula, známy svojimi aktivitami v obchode s homosexuálne orientovanou pornografiou. Prípad je oficiálne vyriešený ako nájomná vražda, ktorú si objednal jeho bývalý milenec. Matula mal prepojenie na politické a hospodárske kruhy, o ktorých zhromaždil kompromitujúce dokumenty a informácie.
16. apríl 1997- Na Lietavskej ulici v Bratislave vybuchla nálož pod autom Seat Ibiza, zaparkovaným vedľa vozidla Mitsubishi Pajero, do ktorého nastupoval jeho vlastník Peter Križanovič, v podsvetí prezývaný Duran. Križanovič bol v dlho trvajúcom spore so Sýkorom o delenie koristi z lúpeže vo VÚB Nitra. Ani táto vražda nebola vyšetrená.
28. apríl 1997 - V Žiline bol odpálením nástražného systému uloženým pod osobným autom zavraždený policajt Miroslav Hnilica, povestný svojím nekompromisným postupom proti kriminálnikom. V pozadí vraždy bol boss kysuckého podsvetia Milan Holáň, prezývaný Gorila.
5. október 1997 - So smrťou zápasiaceho bossa košického podsvetia Róberta Holuba, ležiaceho na ARO v NsP na Kramároch v Bratislave, zastrelil dodnes neznámy páchateľ zo strechy priľahlej budovy. 22. a 24. septembra sa neznámi páchatelia pokúsili Holuba neúspešne zastreliť, pričom pri prestrelke 24. septembra v bratislavskom hoteli Danube, kde Holub utrpel vážne zranenia, bol prítomný aj boss podsvetia z Banskej Bystrice Mikuláš Černák. Holub mal kontakty s agentom SIS Jánom Dopirjakom, viacerými dôstojníkmi SIS a funkcionármi VSŽ. O príslušníkoch SIS Holub zhromažďoval kompromitujúce materiály vo svojom erotickom salóne Evelyn.
19. október 1997 - Na ceste pri Krásne nad Kysucou bol z idúceho auta zastrelený za volantom svojho auta Peter Kalányi zo Žiliny. V pozadí atentátu bol opäť Gorila. Prípad nebol vyriešený.
25. november 1997 - V bare hotela Astoria v Žiline bol zastrelený Gorila. Prípad nebol vyšetrený. Pozorovatelia predpokladajú, že v pozadí vraždy je skupina M. Černáka z Banskej Bystrice.
9. máj 1998 - Odpálením výbušniny umiestnenej pod zemou pri tenisových kurtoch na bratislavských Zlatých pieskoch bol zavraždený boss podsvetia Eduard Dinič. Do jeho salónu Club Tropicana chodil aj riaditeľ SIS I. Lexa. Experti dodnes neurčili, aký druh výbušniny usmrtil Diniča a neidentifikovali ani jeho DNA.