Vládna koalícia HZDS, SNS a ZRS opätovne a hrubým spôsobom porušila Ústavu SR. Jedným z jej prvých krokov, ktorými zneužila právomoc prezidenta vyhlasovať referendum, bolo, že zrušila vyhlásenie času, v ktorom sa vykoná referendum, určené prezidentom Kováčom na 19. apríla tohto roka. M. Kováč tak urobil potom, ako minister vnútra Krajči znemožnil vykonanie referenda v minulom roku a po rozhodnutiach Ústavného súdu zo 6. februára tohto roka, v ktorých konštatoval, že Ministerstvo vnútra SR porušilo ústavné práva občanov zúčastniť sa na referende v máji 1997. Argumentácia vlády SR v súvislosti so zrušením rozhodnutia prezidenta Kováča je podľa pozorovateľov i opozičných politikov prinajmenšom zavádzajúca. V oficiálnom vyhlásení pre agentúru vláda konštatuje, že rozhodnutie prezidenta Kováča nemožno uverejniť v Zbierke zákonov, pretože nie je v súlade so zákonom. Vládna koalícia tak opätovne porušila ústavou stanovený princíp rozdelenia štátnej moci, pretože rozhodnúť o tom, čo je alebo nie je v súlade so zákonom, patrí výlučne do kompetencie súdnej, a nie výkonnej moci.
Podľa stanoviska vlády ďalej nemožno vykonať referendum o troch otázkach týkajúcich sa NATO, ktoré v minulom roku schválila NR SR, pretože by išlo o opakované referendum, ktoré je podľa ústavy možné vykonať až po troch rokoch. Vláda považuje výsledky minuloročného referenda za platné, a to napriek tomu, že Ústredná komisia pre referendum, ktorá je jedinou inštitúciou oprávnenou vyhlasovať výsledky referenda, rozhodla o tom, že toto referendum bolo zmarené. Voči zmarenému referendu nemožno podať sťažnosť na Ústavnom súde. Preto sa naň obrátili občania a súd uznal ich sťažnosti za oprávnené, vyhovel im a rozhodol, že ich ústavné práva boli ministerstvom vnútra porušené. Rozhodnutie vlády zrušiť rozhodnutie prezidenta Kováča je v priamom rozpore s uznesením Ústavného súdu z 5. februára tohto roka. Súd v ňom podal výklad ústavy, podľa ktorého ani v prípade, ak je štátny orgán (vláda SR) presvedčený o tom, že iný štátny orgán (prezident SR) nepostupoval v súlade s ústavou, neoprávňuje ho to k tomu (vládu SR), aby taktiež postupoval v rozpore s platnými zákonmi. Slovenská demokratická koalícia v reakcii na protiústavný krok vlády už vyhlásila, že bude mobilizovať občanov k zakladaniu občianskych výborov a začne novú petičnú akciu za vyhlásenie referenda o priamej voľbe hlavy štátu.